松花江畔，冰城夏都，有一所被誉为“工程师摇篮”的应用型本科院校——黑龙江工程学院。
2000年，站在历史与未来的分割点，黑龙江工程学院汇聚原黑龙江交通高等专科学校和哈尔滨工程高等专科学校的办学资源，传承两所学校近半个世纪的厚重积淀，开启了建设特色鲜明的高水平应用技术大学的筑梦、逐梦之旅。
筑梦未来——以国家需要为第一使命，以龙江需求为第一责任，以人民满意为第一标准
办好应用型大学、培养应用型人才的梦想，犹如地平线上跳动着的朝阳，厚积薄发、喷薄而出。学校紧扣高等教育时代脉搏，遵循高等教育发展规律，坚持“地方性、应用型、国际化”，以国家需要为第一使命，以龙江需求为第一责任，以人民满意为第一标准，为党育人，为国育才。
本科建设伊始，学校坚持错位性竞争、差异性发展的思路，发扬传统办学优势，加快合校升本深度融合，实现了从专科教育向工程应用型本科教育的快速转型。2003年，学校成为学士学位授予单位，7个专业获学士授权，本科教育进入全新发展阶段。
抓住国家开展本科教学工作水平评估、实施本科教学质量与教学改革工程的契机，2005年起，学校举全校之力推进教学基本建设，强化教学管理，深化教学改革。“以评促建，以评促改，以评促管，评建结合，重在建设”。2008年，学校通过教育部本科教学工作水平评估，夯实了本科办学基础。
这一时期，学校先后成为教育部卓越工程师教育培养计划首批试点院校、黑龙江省特色应用型本科院校建设试点单位、黑龙江省人才培养模式创新实验区，被列入高教强省建设规划，成为唯一一所同时承担国家和黑龙江省试点任务的省属高校。“三项试点”为本科建设装上了推进器，推动学校教育教学水平、人才培养质量和办学综合实力全方位提升。
立足龙江、面向全国、放眼世界，学校在特色应用型办学道路上越走越稳健、越走越有信心。
逐梦新时代——应用为本，追求卓越，建设特色鲜明的高水平应用技术大学
聚焦国家创新驱动发展战略，学校牢固树立科技创新服务方向，完善科技创新服务体系，推动科技成果立地转化，助力区域经济社会发展和龙江振兴。
2015年，国家国防科技工业局和黑龙江省人民政府签署共建黑龙江工程学院协议，学校改革发展与国家重大战略、国防科技工业发展更加紧密地联系在一起。动力、光学、计算机等学科领域先后被国家国防科技工业局确定为国防特色学科。
也是在2015年，经国家人力资源和社会保障部、全国博士后管理委员会批准，学校华正交通工程监理有限责任公司博士后科研工作站、测量工程公司博士后科研工作站正式挂牌，为人才培养、科学研究和社会服务拓宽了渠道。
省重点实验室、省工程技术研究中心、省级协同创新中心、省高校重点实验室、省高校校企共建工程研发中心等一大批高水平科研平台，如雨后春笋般蓬勃发展。
这一时期，学校按照国家引导部分地方普通本科高校向应用型转变的战略部署，贯彻新发展理念，以新工科和专业集群建设为牵动，大力实施“转型发展”重大专项行动。将办学思路转到服务地方经济社会和行业发展、服务国防科技工业发展上来，转到产教融合、科教融合，协同育人、协同创新上来，转到培养应用型、复合型、创新型人才上来，推进新建学院向新型大学转型。学校率先在全省地方本科高校中通过教育部本科教学工作审核评估，成为地方高校转型发展的排头兵，牢固确立了同类院校省内领先、全国前列地位。
学校瞄准应用型定位，强化应用学科专业建设，调整优化结构，培育优势特色学科专业。本科专业从2001年的14个，发展到现在的57个、7个专业集群，专业链与产业链符合度不断提升。2017年，学校成为新增硕士学位授权建设高校。“以工科为主体，以经济管理、人文艺术为两翼”的学科专业布局初步形成。
对标国家一流本科专业建设“双万计划”，学校深化专业综合改革，推进专业三级认证。继测绘工程专业成为国家级特色专业之后，电气工程及其自动化专业获批成为国家级一流专业建设点。一批省级一流专业建设点和省级一流课程成功立项。
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